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系统生物学电子书

系统生物学的基本概念和原理:生物系统是一个复杂的系统,它包括不同的组分以及它们之间的相互作用。

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作       者:林标扬

出  版  社:浙江大学出版社

出版时间:2012-06-01

字       数:16.7万

所属分类: 科技 > 自然科学 > 生物科学

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系统生物学的基本概念和原理:生物系统是一个复杂的系统,它包括不同的组分以及它们之间的相互作用。它可以用网络系统来模拟。生物系统的网络结构具有无尺度(Scale‐free)网络结构的特性,即少数大的枢纽和多数小的连接。

     《系统生物学》由林标扬编著,本书将介绍系统生物学的基本概念和原理(第一篇),然后介绍系统生物学研究的高通量技术和手段,包括蛋白质组学、基因组学、转录组学和代谢组学等研究手段(第二篇),最后介绍系统生物学数据整合分析、计算和模拟的工具(第三篇),供读者阅读学习。


【作者】

     林标扬,首席科学家,曾为美国系统生物学研究所癌症研究组带头人8年,现为浙江大学教授,美国华盛顿大学兼职副教授。1994年毕业于加拿大大不列颠哥伦比亚大学(UBC),获医学遗传学博士。随后游学欧洲,先后在英国帝国癌症研究中心、德国威尔茨堡大学(为洪堡学者)工作。1998起师从系统生物学创始人、“国际系统生物学之父”、美国系统生物学研究所总裁、美国三院院士Leroy Hood教授。2006年在浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院创立了系统生物学平台。


目录展开

第1章 复杂系统的研究方法

第2章 等级层次理论

第3章 系统生物学是一门整合不同数据的交叉学科

第4章 网络和网络系统生物学

第5章 阶层网络

第6章 生物网络模体

第7章 生成随机网络的算法

第8章 常用的网络分析软件

第9章 新兴的高通量测序技术

第10章 第二、三代测序技术间的过渡

第11章 总结

第12章 新兴高通量测序技术

第13章 新兴高通量测序技术在组蛋白修饰研究中的应用

第14章 未来测序技术面临的挑战

第15章 质谱的基本原理

第16章 生物分析物的分离

第17章 定量蛋白质组学

第18章 基于串联质谱的蛋白质定性分析

第19章 常用同位素标记定量蛋白组学方法

第20章 无标记定量蛋白质组学

第21章 格式转化软件

第22章 蛋白质组学数据分析平台

第23章 亚蛋白质组学

第24章 糖基化蛋白质组

第25章 多肽组学

第26章 CMS/LCMS 代谢组学分析

第27章 发展与展望

第28章 基因调控网络

第29章 因特网上的数据库和工具

第30章 组学数据库

第31章 GEO基因表达数据的存储结构

第32章 生物途径网络数据库

第33章 基因本体注释和分类

第34章 蛋白结构数据库PDB

第35章 TRANSFAC和EPD转录子数据库

第36章 BRENDA数据库

第37章 基因组微阵列

第38章 生物系统建模工具

第39章 蛋白质与其他分子相互作用

第40章 蛋白质小分子结合位点的预测

第41章 蛋白质DNA 结合位点预测算法

第42章 系统生物学模拟工具

第43章 MathSBML软件具体应用

第44章 CellDesigner 的主要特征

第45章 Cytoscape数据整合及网络显示分析平台软件

第46章 最佳子集法1925.5MS定量生物分析

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