从20世纪70年代Cleve Moler发MATLAB始, MATLAB受到学术界和工业界的欢迎,用户超过200万。然而,很多算法的MATLAB实现代码都有加速的需求。以深度学习为例,相关的MATLAB代码需要运行数小时甚至数天的时间。GPU计算和CUDA编程为MATLAB加速提供了很好的解决方案。现代的硬件技术的发展,使MATLAB程序的发者和使用者能够拥有多核(multicore)、大内存等有效工具;图形处理器(Graphics Processing Unit,GPU)具有很好的加速能力。同时,一些公司还推出了专用的计算加速卡,如英伟达公司的Tesla系列计算加速卡、AMD公司的Fire Pro系列计算加速卡、Intel公司的Xeon Phi计算加速卡等。GPU是现代计算机的配件,都有不错的加速能力。GPU的主要生产厂商包括英伟达公司和AMD公司。MATLAB通过并行计算工具箱(Parallel Computing Toolbox,PCT)对英伟达公司的GPU单卡提供支持,MATLAB的发者和使用者可以通过PCT使用英伟达公司生产的GPU。需要英伟达公司GPU多卡的计算支持和对英伟达公司GPU计算加速性能要求极致的程序员,可以通过MATLAB与C / C 程序或者Fortran程序的口,获得计算性能的提升。MATLAB不直提供对AMD公司GPU的提供支持,MATLAB的发者和使用者需要对AMD公司生产的GPU编写程序,并通过MATLAB与C / C 程序或者Fortran程序的口功能(wrapper function),获得MATLAB对AMD公司的GPU的支持。《加速MATLAB编程指南:CUDA实现》基于作者多年GPU计算与加速的研究和经验[1-10],全面叙述了基于CUDA编程的加速MATLAB编程的方法。《加速MATLAB编程指南:CUDA实现》适应于各行各业利用MATLAB行算法发,并且对MATLAB程序有加速需求的专业人员。《加速MATLAB编程指南:CUDA实现》主要是面向满足日常办公需要的个人计算机(Personal Computer,PC)和服务器(Server),并安装了GPU加速卡。
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内容简介
作者简介
序一 preface
序二 preface
前言 foreword
第1章 绪论
1.1 MATLAB程序的加速
1.2 MATLAB程序加速的可能途径
1.2.1 基于多核CPU的MATLAB程序加速
1.2.2 基于大内存的MATLAB程序加速
1.2.3 基于英伟达公司GPU的MATLAB程序加速
1.2.4 基于AMD公司GPU的MATLAB程序加速
1.2.5 基于Intel公司Xeon Phi的MATLAB程序加速
1.3 MATLAB程序加速的度量
1.4 基于GPU计算的MATLAB程序的编制
1.4.1 并行计算工具箱简介
1.4.2 CUDA库
1.4.3 CUDA编程
第2章 MATLAB程序的性能评估
2.1 bench()函数
2.2 tic()函数/toc()函数
2.3 timeit()函数
2.4 cputime()函数
2.5 clock()函数和etime()函数
2.6 gputimeit()函数
2.7 MATLAB探查器
第3章 基于多核处理器的MATLAB程序加速
3.1 MATLAB矩阵及运算符
3.1.1 MATLAB矩阵的创建
3.1.2 矩阵的性质的检验
3.1.3 MATLAB矩阵的操作
3.2 MATLAB函数
3.2.1 MATLAB函数的定义
3.2.2 MATLAB函数的执行
3.3 语句与代码
3.3.1 分支结构
3.3.2 循环结构
3.4 MATLAB代码
3.5 MATLAB并行设置
3.6 基于并行for循环(parfor循环)的MATLAB程序加速
第4章 基于大内存的MATLAB程序的加速
4.1 内存条的选择与安装
4.2 内存预分配
4.2.1 已知数组大小
4.2.2 未知数组大小
4.3 MATLAB向量化简介
4.4 MATLAB矩阵运算的向量化
4.4.1 创建MATLAB矩阵的函数
4.4.2 数据复制
4.4.3 MATLAB的矩阵变换函数
4.4.4 索引
4.4.5 矩阵操作的向量化
4.4.6 符合条件的元素总数
4.5 MATLAB函数的向量化
4.5.1 基于arrayfun()函数、bsxfun()函数、cellfun()函数、spfun()函数和structfun()函数的向量化
4.5.2 基于pagefun()函数的向量化
4.6 MATLAB语句的向量化
第5章 基于并行计算工具箱的MATLAB加速
5.1 GPU卡的选择与安装
5.1.1 GPU卡的选择
5.1.2 电源功率
5.1.3 散热问题
5.2 基于并行计算工具箱的GPU计算简介
5.3 基于并行计算工具箱的矩阵运算
5.3.1 在设备端(GPU端)直接创建MATLAB矩阵
5.3.2 在设备端(GPU端)生成随机数矩阵
5.3.3 设备端(GPU端)的稀疏矩阵
5.3.4 设备端(GPU端)矩阵的数据类型
5.3.5 设备端(GPU端)矩阵的检验
5.3.6 设备端(GPU端)矩阵的操作
5.4 基于并行计算工具箱的设备端(GPU端)函数
5.4.1 设备端(GPU端)函数的定义
5.4.2 设备端(GPU端)函数的执行
5.5 基于设备端(GPU端)大内存的MATLAB程序的加速
5.6 例子
5.6.1 卷积神经网络前向传播的卷积层
5.6.2 卷积神经网络前向传播的激活函数
5.6.3 卷积神经网络前向传播的降采样层
5.6.4 卷积神经网络后向传播的升采样层
5.6.5 卷积神经网络后向传播的卷积层
5.6.6 卷积神经网络后向传播中的梯度计算
第6章 MATLAB与C/C++的接口
6.1 MEX库API
6.1.1 MEX相关的函数
6.1.2 从MEX中调用MATLAB函数
6.1.3 mexGet()函数
6.1.4 MEX库API与输入输出相关的函数
6.1.5 MEX库API与锁定相关的函数
6.2 MATLAB的C/C++矩阵库API
6.2.1 定义MEX函数的数据类型
6.2.2 创建数组、分配内存和释放内存
6.2.3 数据类型校验:数组的数据类型和性质
6.2.4 数据存取:从数组读取和写入数据
6.2.5 数据类型转换:将字符串数组和结构数组转换成对象数组
6.3 MEX函数编译器
6.3.1 MEX介绍
6.3.2 编译MEX
6.3.3 MEX文件的查错
第7章 基于CUDA库的MATLAB加速
7.1 基于CUDA库的MATLAB加速简介
7.2 基于ArrayFire库的MATLAB加速简介
7.2.1 ArrayFire简介
7.2.2 ArrayFire数组
7.2.3 ArrayFire函数
7.2.4 CUDA的混合编程
7.2.5 实例
7.3 基于其他CUDA库的MATLAB加速简介
第8章 GPU计算简介
8.1 芯片技术的发展与摩尔定律
8.2 每秒浮点运算次数
8.3 GPU计算加速的度量
8.3.1 GPU程序的加速比
8.3.2 阿姆达尔定律和古斯塔夫森定律
8.3.3 并行程序的并行状况
8.4 并行计算部件
8.4.1 张量处理器
8.4.2 现场可编程门阵列
8.4.3 类脑处理器
8.4.4 视觉处理器
8.4.5 物理处理器
8.4.6 图形处理器
8.5 英伟达公司GPU简介
8.5.1 计算单元
8.5.2 GPU内存
8.5.3 计算能力
8.5.4 GPU当前状态的检测
8.5.5 GPU集群设置
8.5.6 集群管理软件
第9章 CUDA编程简介
9.1 CUDA核
9.2 CUDA线程与线程块
9.2.1 CUDA线程
9.2.2 CUDA线程块
9.3 内存结构与管理
9.3.1 全局内存
9.3.2 共享内存
9.3.3 锁页内存
9.3.4 纹理内存和表面内存
9.4 并行管理
9.4.1 非同步并行执行
9.4.2 流和事件
9.4.3 同步调用
9.5 CUDA流
9.5.1 CUDA流的创建和结束
9.5.2 默认CUDA流
9.5.3 显式同步
9.5.4 隐式同步
9.5.5 重叠行为
9.5.6 回调函数
9.5.7 CUDA流的优先级
9.6 CUDA事件
9.6.1 CUDA事件的创建与清除
9.6.2 CUDA事件的运行
9.7 多设备系统
9.7.1 多设备系统的初始化
9.7.2 多设备系统的设备计数
9.7.3 多设备系统的设备选择
9.7.4 多设备系统的CUDA流和CUDA事件
9.7.5 不通过统一虚拟地址的多设备系统的设备间的内存复制
9.7.6 通过统一虚拟地址的多设备系统的设备间的内存复制
9.8 动态并行
9.8.1 动态并行简介
9.8.2 动态并行的编程模型
9.8.3 动态并行的环境配置
9.8.4 动态并行的内存管理
9.8.5 动态并行的嵌套深度
9.9 统一虚拟地址空间
9.9.1 统一虚拟地址空间简介
9.9.2 统一内存编程的优点
9.9.3 统一内存分配
9.9.4 统一内存的连续性与并行性
9.9.5 统一内存的检验
9.9.6 统一内存的性能优化
9.10 CUDA的编译
9.10.1 CUDA编译工作流
9.11 CUDA程序实例
9.11.1 序列蒙特卡罗的类别分布随机数
9.11.2 哈尔变换
第10章 CUDA程序优化
10.1 CUDA程序优化的策略
10.2 指令级别的优化
10.2.1 算术指令吞吐量最大化
10.2.2 控制流指令
10.2.3 同步指令
10.3 线程和线程块级别的优化
10.3.1 warp简介
10.3.2 CUDA线程块的warp数量
10.3.3 CUDA占用率
10.3.4 线程warp对设备端(GPU端)内存读写
10.4 CUDA核级别的优化
10.4.1 优化CUDA核参数
10.4.2 减少内存同步
10.4.3 减少寄存器总量
10.4.4 提高指令层次的并行度
10.5 CUDA程序级别的优化
第11章 基于CUDA的MATLAB加速
11.1 基于CUDAKernel的MATLAB加速
11.2 基于MEX函数的MATLAB加速
11.3 多GPU编程
11.4 例子
11.4.1 基于MEX函数的多GPU矩阵相加
11.4.2 基于MEX函数的多GPU的LSE函数
第12章 总结
12.1 加速MATLAB编程方法的比较
12.2 进一步加速MATLAB
12.2.1 多路多核处理器的MATLAB程序加速
12.2.2 基于AMD公司GPU的MATLAB程序加速
12.2.3 基于Intel公司Xeon Phi的MATLAB程序加速
参考文献
附录CD
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