二穗短柄草中抗病基因家族的分析及机器学习预测方法研究电子书
抗病基因对植物的生长发育起着非常重要的免疫调控作用,植物中抗病基因的数量和特征对该植物的 抗病机制研究至关重要。 本书可供基因分析及机器预测学习方法研究人员参考。
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本书选择禾本科植物二穗短柄草作为研究对象,系统鉴定了该物种内重要的一 类抗病基因家族,这类抗病基因所编码的蛋白具有核苷酸结合结构域(NBS, Nucleotide Binding Site)和亮氨酸 重复结构域(LRR, Leucine-Rich Repeats),并系统分析了这些抗病基因。 在获得二穗短柄草中的 NBS-LRR 抗 病基因列表后,继续研究了其数字序列特征,并应用机器学习中的支持向量机算法对这些特征行训练建 模,构建和优化后的机器学习模型,可实现对其他已测序物种的快速抗病基因鉴定。
目录展开
1 绪论
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS-LRR 的鉴定与生物信息学分析
3 二穗短柄草 NBS-LRR 抗病基因家族的表达谱分析
4 NBS-LRR 基因家族预测算法的设计与应用
5 总结与展望
附录
参考文献
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