基因组设计合成与功能化技术电子书

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内容简介

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《合成生物学工程技术丛书》编委会

《基因组设计合成与功能化技术》分册编委

序言

前言

第1章　基因组设计技术

1.1　基因组模块化与成簇化

1.1.1　基因组模块化设计

1.1.2　基因组成簇化设计

1.2　基因组简化

1.3　基因组扩展

1.4　基因组重排

1.4.1　设计原理概述

1.4.2　人工基因组重排策略

1.5　密码子重编

1.5.1　密码子重编基本原理

1.5.2　密码子简化

1.5.3　密码子重分配

1.6　基因组设计软件

1.6.1　计算机程序辅助合成基因组的发展过程

1.6.2　计算机程序在合成基因组中的应用

参考文献

第2章　基因线路设计技术

2.1　基因线路的正交化设计

2.1.1　DNA存储与复制的正交化设计

2.1.2　转录调控的正交化设计

2.1.3　翻译及翻译后调控的正交化设计

2.2　基因线路的标准化和模块化设计

2.3　基因线路的自动化设计

2.4　基因线路的其他调控设计

参考文献

第3章　基因组合成技术

3.1　寡核苷酸合成与纯化

3.1.1　化学合成寡核苷酸法

3.1.2　酶促合成寡核苷酸法

3.1.3　寡核苷酸纯化

3.2　基因合成

3.2.1　从寡核苷酸到双链DNA

3.2.2　多个双链DNA的组装

3.3　基因组的组装

3.3.1　复制子切除增强重组技术（REXER）

3.3.2　减数分裂重组介导的组装（MRA）

3.3.3　Cas9促进的同源重组组装（CasHRA）

3.4　基因与基因组合成中的纠错与修复技术

3.4.1　DNA错配结合蛋白（MutS）纠错技术

3.4.2　DNA错配切割蛋白纠错技术

3.4.3　酵母基因组缺陷靶点快速定位与修复方法

3.4.4　CRISPR/Cas9介导的多靶点共转化修复

参考文献

第4章　大片段DNA转移技术

4.1　技术概念与发展

4.2　化学法

4.2.1　化学法转移技术的概念与原理

4.2.2　原生质体转移法

4.2.3　脂质体转染法

4.2.4　醋酸锂转移法

4.2.5　其他方法

4.3　生物法

4.3.1　生物法转移技术的概念与原理

4.3.2　接合转移

4.3.3　细胞原生质体融合转移法

4.3.4　酵母交配转移法

4.3.5　病毒载体转染法

4.3.6　微细胞介导染色体转移法

4.3.7　其他方法

4.4　物理法

4.4.1　物理法转移技术的概念与原理

4.4.2　显微注射法

4.4.3　电击法

4.4.4　基因枪法

参考文献

第5章　合成基因组的功能化应用技术

5.1　合成基因组学疫苗技术

5.1.1　技术概念与发展

5.1.2　合成基因组学疫苗技术的应用原理

5.1.3　合成基因组学疫苗技术的操作规程

5.1.4　常见问题与解决方案

5.1.5　相关案例与分析

5.2　代谢工程底盘快速进化技术

5.2.1　技术概念与发展

5.2.2　代谢工程底盘快速进化技术的原理

5.2.3　代谢工程底盘快速进化技术的操作规程

5.2.4　常见问题与解决方案

5.2.5　应用案例与分析

5.3　基因组精简技术

5.3.1　技术概念与发展

5.3.2　基因组精简技术的原理

5.3.3　基因组精简技术的操作规程

5.3.4　常见问题与解决方案

5.3.5　应用案例与分析

5.4　人工生命防逃逸系统

5.4.1　技术概念与发展

5.4.2　人工生命防逃逸系统的原理

5.4.3　人工生命防逃逸系统的操作规程

5.4.4　常见问题与解决方案

5.4.5　应用案例与分析

参考文献

第6章　基因组设计合成应用实例

6.1　病毒基因组合成与应用

6.1.1　脊髓灰质炎病毒基因组合成

6.1.2　噬菌体ϕX174基因组合成

6.1.3　噬菌体T7基因组合成

6.1.4　冠状病毒（CoV）基因组合成

6.1.5　流行病疫苗的快速开发

6.1.6　减活病毒疫苗的开发

6.2　原核生物基因组合成与应用

6.2.1　生殖支原体基因组合成

6.2.2　丝状支原体基因组（JCVI-syn1.0）合成

6.2.3　丝状支原体最小基因组（JCVI-syn3.0）合成

6.2.4　大肠杆菌基因组设计与合成

6.3　真核生物基因组合成与应用

6.3.1　酿酒酵母基因组合成与应用

6.3.2　动物和植物的人工染色体合成与应用

参考文献