复方苦参抗肿瘤精准网络药理学研究电子书

书名页

编委会

陈序

周序

唐序

前言

上篇

第一章　复方苦参注射液抗肿瘤研究进展

第一节　复方苦参注射液治疗胃癌的研究进展

一、复方苦参注射液治疗胃癌的临床研究

1.提高疗效和患者生存质量

2.治疗恶性腹腔积液

3.保护患者免疫系统

4.缓解癌痛

5.减轻化疗不良反应

二、复方苦参注射液治疗胃癌的作用机制研究

1.抑制肿瘤组织血管生成

2.抑制肿瘤细胞增殖，促进肿瘤细胞凋亡

3.抑制肿瘤细胞的侵袭和迁移

第二节　复方苦参注射液治疗食管癌的研究进展

一、复方苦参注射液治疗食管癌的临床研究

1.复方苦参注射液联合化疗方案治疗食管癌

2.复方苦参注射液联合放疗方案治疗食管癌

3.复方苦参注射液联合同步放化疗方案治疗食管癌

二、复方苦参注射液治疗食管癌的作用机制研究

1.抑制癌细胞增殖，诱导癌细胞凋亡

2.改善细胞免疫功能

第三节　复方苦参注射液治疗乳腺癌的研究进展

一、复方苦参注射液治疗乳腺癌的临床研究

1.提高疗效和患者生存质量

2.保护患者机体免疫系统

3.减少不良反应

5.对血清肿瘤标志物的影响

二、复方苦参注射液治疗乳腺癌的作用机制研究

1.抑制肿瘤细胞增殖，促进肿瘤细胞凋亡

2.抑制肿瘤细胞的迁移、侵袭和血管生成

3.其他机制

第四节　复方苦参注射液治疗其他肿瘤的研究进展

一、复方苦参注射液在肺癌治疗中的应用

二、复方苦参注射液在肝癌治疗中的应用

三、复方苦参注射液在结肠癌治疗中的应用

四、复方苦参注射液在胰腺癌治疗中的应用

五、复方苦参注射液在鼻咽癌治疗中的应用

第二章　网络药理学在中医药研究中的应用

第一节　精准网络药理学的概念

一、网络药理学的基本概念与学科特点

二、网络药理学的基本研究流程

1.数据采集与整合

2.数据预处理

3.网络构建与分析

4.生物实验验证

三、精准网络药理学概念的提出与实践

1.中成药

2.经典方剂

3.中药材

4.中药单体

第二节　网络药理学常用数据库

一、ETCM数据库

二、SymMap数据库

三、BATMAN-TCM数据库

四、TCMID数据库

五、TCMSP数据库

六、HERB数据库

第三节　网络药理学常用靶点预测方法

一、基于配体结构相似性和定量构效关系的分析

二、反向分子对接

三、基于作用网络模拟的分析

四、基于机器学习的分析

第四节　网络药理学在中医药中的应用实例

一、中药作用机制研究

二、探究中药配伍联用规律与机制

三、探究中药/西药联用机制

四、网络药理学与其他技术的联合应用

五、总结与展望

第三章　组学技术在中医药研究中的应用

第一节　转录组学在中医药中的应用进展

一、转录组学在生药学研究中的应用

二、转录组学在中药药效作用机制研究中的应用

三、转录组学在中药复方作用机理研究中的应用

四、转录组学在中医疾病诊疗研究中的应用

第二节　蛋白质组学在中医药中的应用进展

一、蛋白质组学在生药学研究中的应用

二、蛋白质组学在中药药效作用机制研究中的应用

三、蛋白质组学在中药复方作用机理研究中的应用

四、蛋白质组学在中医疾病诊疗研究中的应用

五、总结与展望

第三节　单细胞测序在中医药领域的应用

一、单细胞测序在中医证候研究中的应用

二、单细胞测序在中药汤剂研究中的应用

三、单细胞测序在中成药作用机制研究中的应用

四、单细胞测序在中药药效物质研究中的应用

五、单细胞测序在中药安全性研究中的应用

六、总结与展望

第四节　组学数据常用分析方法

一、组学数据基本概念介绍

1.基因芯片表达谱

2.高通量测序表达谱

二、差异分析（解析差异基因或差异蛋白）

1.差异分析基本概念

2.常见差异基因分析工具

三、聚类分析（解析基因复杂的表达模式）

1.聚类分析基本概念

2.聚类策略

四、基因富集分析（预测基因生物学功能）

1.基因富集分析基本概念

2.常用基因富集分析方法

五、基因网络分析（发掘关键基因模块）

1.基因共表达网络

2.蛋白质-蛋白质互作网络

下篇

第四章　复方苦参注射液干预胃癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预胃癌的药效学评价

一、复方苦参注射液对胃癌小鼠模型的干预作用

（一）研究材料

（二）研究方法

1.胃癌小鼠模型的构建

2.药物干预方案

3.实验与检测项目

4.统计学分析

（三）研究结果

1.小鼠基础生理指标情况

2.小鼠肿瘤学指标情况

3.复方苦参注射液改善小鼠血液学指标

4.复方苦参注射液改善小鼠免疫学指标

二、复方苦参注射液对多种胃癌细胞模型的干预作用

（一）研究材料

（二）研究方法

1.细胞复苏、细胞常规培养和细胞冻存方法

2.实验与检测项目

3.统计学分析

（三）研究结果

1.复方苦参注射液抑制胃癌细胞活力和增殖能力

2.复方苦参注射液抑制胃癌细胞黏附能力

3.复方苦参注射液抑制胃癌细胞迁移、侵袭能力

第二节　基于组学联合分析的复方苦参注射液对胃癌细胞ceRNA网络调控研究

一、研究材料

二、研究方法

1.组学数据准备和ceRNA网络评分（ceRNA network score，CNScore）

2.相关性分析和lncRNA亚细胞定位预测

三、研究结果

1.复方苦参注射液干预胃癌细胞异常表达基因的筛选结果

2.基于转录组学的复方苦参注射液干预胃癌细胞异常表达基因ceRNA网络（复方苦参注射液-胃癌ceRNA网络Ⅰ）

3.基于蛋白质组学的复方苦参注射液干预胃癌细胞异常表达基因ceRNA网络（复方苦参注射液-胃癌ceRNA网络Ⅱ）

4.基于临床信息的复方苦参注射液干预胃癌细胞异常表达基因ceRNA网络（复方苦参注射液-胃癌ceRNA网络Ⅲ）

5.复方苦参注射液干预胃癌细胞核心ceRNA网络的CNScore分析结果

6.复方苦参注射液干预胃癌细胞关键ceRNA轴的分析结果

第三节　复方苦参注射液干预胃癌作用机制分子生物学研究

一、研究材料

二、研究方法

1.实验与检测项目

2.统计学分析

三、研究结果

1.复方苦参注射液干预PTPRG-AS1/hsa-miR-421/KITLG轴且抑制KITLG/KIT通路

2.复方苦参注射液基于PTPRG-AS1/hsa-miR-421/KITLG轴抑制胃癌细胞恶性表型

3.复方苦参注射液基于PTPRG-AS1/hsa-miR-421/KITLG轴抑制胃癌细胞KITLG/KIT通路

第五章　复方苦参注射液干预乳腺癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌的网络药理学研究

一、研究方法

1.转录组测序数据的获取

2.转录组测序数据上游分析

3.基因差异表达分析

4.基因集富集分析

5.计算肿瘤免疫浸润相对丰度

6.筛选免疫相关预后基因

7.构建免疫相关基因预后模型

8.统计分析

二、研究结果

1.复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌细胞系转录组差异表达分析

2.复方苦参注射液调节的信号通路分析

3.三阴性乳腺癌免疫分型和免疫相关基因

4.复方苦参注射液调节的关键免疫基因及其预后价值分析

第二节　复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌细胞系的研究

一、研究材料

1.实验细胞

2.实验药品

二、研究方法

1.实验与检测项目

2.统计与分析

三、研究结果

1.复方苦参注射液对MDA-MB-231细胞活力的影响

2.复方苦参注射液对MDA-MB-231细胞克隆形成能力的影响

3.复方苦参注射液对MDA-MB-231细胞迁移能力的影响

第三节　基于蛋白质组的复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌作用机制研究

一、研究材料

1.实验细胞

2.实验药品

二、研究方法

1.质谱实验方法

2.蛋白质组数据分析步骤

3.统计分析

三、研究结果

1.蛋白差异表达分析

2.基因集富集分析

3.基因集变异分析

4.差异蛋白预后分析

5.肿瘤免疫浸润相关性分析

第四节　复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌单细胞转录组研究

一、复方苦参注射液对三阴性乳腺癌小鼠的抑瘤作用研究

（一）研究材料

1.实验动物及细胞

2.实验药品

（二）研究方法

1.实验分组、给药方法与剂量

2.小鼠常规观察与肿瘤监测

3.实验与检测项目

4.统计与分析

（三）研究结果

1.小鼠健康状况、体重和肿瘤体积

2.小鼠肿瘤和脏器组织病理学观察

3.小鼠肿瘤组织细胞凋亡情况

4.脾脏淋巴细胞亚群差异

5.肿瘤浸润淋巴细胞亚群差异

二、基于单细胞转录组的复方苦参注射液干预三阴性乳腺癌作用机制研究

（一）研究材料

（二）研究方法

1.单细胞转录组测序

2.单细胞转录组测序数据分析

3.统计与分析

（三）研究结果

1.单细胞转录组测序结果质控和数据过滤

2.多样本整合与PCA降维

3.细胞亚群的聚类结果

4.细胞类型的鉴定结果

5.T淋巴细胞亚群分析

6.单细胞GSEA分析结果

第六章　复方苦参注射液干预鼻咽癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预鼻咽癌的网络药理学研究

一、研究方法

1.复方苦参注射液成分预测靶点网络的构建

2.鼻咽癌相关靶点的搜集

3.蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建

4.富集分析

5.分子对接

二、研究结果

1.复方苦参注射液成分及靶点网络

2.鼻咽癌相关靶点与PPI网络

3.富集分析

4.分子对接

5.药物-化合物-靶点-通路网络

第二节　复方苦参注射液干预鼻咽癌的实验研究

一、研究材料

二、研究方法

1.细胞培养

2.实验与检测项目

3.数据分析

三、研究结果

1.复方苦参注射液对鼻咽癌细胞增殖的影响

2.复方苦参注射液对鼻咽癌细胞迁移侵袭的影响

3.复方苦参注射液对鼻咽癌细胞凋亡的影响

4.表达差异分析

5.亚细胞定位与结构域分析

6.PPI网络分析

7.富集分析

8.复方苦参注射液对细胞周期相关蛋白表达的影响

9.复方苦参注射液对细胞周期相关mRNA表达的影响

第七章　复方苦参注射液干预胰腺癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预胰腺癌的网络药理学研究

一、研究方法

1.复方苦参注射液的化学成分与靶点收集

2.胰腺癌相关基因的收集

3.蛋白质-蛋白质相互作用信息

4.网络构建

5.模块分析及富集分析

6.分子对接

二、研究结果

1.复方苦参注射液化合物-潜在靶点网络

2.胰腺癌相关基因

3.复方苦参注射液化合物靶点-胰腺癌靶点蛋白互作网络

4.模块分析及功能富集分析

5.分子对接

6.药物-化合物-蛋白互作靶点-通路网络

第二节　复方苦参注射液干预胰腺癌的实验研究

一、研究材料

二、研究方法

1.实验与检测项目

2.统计分析

三、研究结果

复方苦参注射液的抗胰腺癌效应及关键靶点验证

第八章　复方苦参注射液干预肝癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预肝癌的网络药理学研究

一、研究方法

1.复方苦参注射液的化学成分与靶点收集

2.肝细胞癌相关基因的收集

3.网络构建

4.富集分析

5.生存分析及关联性分析

6.分子对接

二、研究结果

1.复方苦参注射液化合物-潜在靶点网络

2.肝细胞癌相关基因

3.化合物-肝细胞癌靶点网络

4.GO富集和KEGG通路富集分析

5.关键靶点的生存分析和关联性分析

6.分子对接

7.药物-化合物-靶点-通路网络

第二节　复方苦参注射液干预肝癌的实验研究

一、研究材料

二、研究方法

1.实验与检测项目

2.统计分析

三、研究结果

1.复方苦参注射液抑制肝细胞癌细胞增殖

2.复方苦参注射液对HepG2细胞中ADH1A、CDK1、EPHX2和SRD5A2的调控

第九章　复方苦参注射液干预食管癌的研究

第一节　复方苦参注射液干预食管癌的网络药理学研究

一、研究方法

1.加权基因共表达网络分析

2.网络药理学分析

3.分子对接

4.关键基因的生存分析

二、研究结果

1.WGCNA模块构造

2.WGCNA的关键模块选择

3.复方苦参注射液治疗食管癌的活性成分-潜在靶点网络

4.GO富集和KEGG通路富集分析

5.分子对接

6.生存分析

第二节　复方苦参注射液干预食管癌的实验研究

一、研究材料

1.研究药物与实验细胞

2.实验仪器与器材

二、研究方法

1.实验与检测项目

2.统计分析

三、研究结果

1.复方苦参注射液对Eca-109食管癌细胞增殖的影响

2.复方苦参注射液对Eca-109细胞mRNA和蛋白表达的影响

参考文献