细胞特性表征与高通量筛选技术电子书

内容简介

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目录

1.1　细胞的发现及微生物细胞的应用历史

1.1.1　细胞的发现

1.1.2　微生物细胞的应用历史

1.2　微生物细胞改造技术发展历程

1.2.1　随机诱变

1.2.2　基因工程改造

1.3　细胞高通量表征与筛选技术

参考文献

2.1　细胞培养技术的原理和原则

2.1.1　微生物细胞的培养原理与基本原则

2.1.2　植物细胞的培养原理与基本原则

2.1.3　动物细胞的培养原理与基本原则

2.2　细胞培养技术的方法介绍

2.2.1　微生物细胞的培养方法与常用培养基介绍

2.2.2　植物细胞的培养方法与常用培养基介绍

2.2.3　动物细胞的培养方法与常用培养基介绍

2.3　细胞培养过程中的常见问题及应对措施

2.3.1　微生物细胞培养过程中的常见问题及应对措施

2.3.2　植物细胞培养过程中的常见问题及应对措施

2.3.3　动物细胞培养过程中的常见问题及应对措施

2.4　细胞培养技术在特性表征与高通量筛选中的应用

2.4.1　微生物培养技术在特性表征与高通量筛选中的应用

2.4.2　植物细胞培养技术在特性表征与高通量筛选中的应用

2.4.3　动物细胞培养技术在特性表征与高通量筛选中的应用

参考文献

3.1　光学技术的基本原理

3.1.1　流式细胞荧光分选技术

3.1.2　紫外光谱技术

3.1.3　圆二色谱技术

3.1.4　拉曼光谱技术

3.1.5　红外光谱技术

3.2　细胞特性的光谱表征方法——样品处理及数据分析

3.2.1　流式细胞仪的使用

3.2.2　紫外光谱仪的使用

3.2.3　圆二色谱仪的使用

3.2.4　拉曼光谱仪的使用

3.2.5　红外光谱仪的使用

3.3　光学技术在细胞性能表征方面的应用

3.3.1　在细胞分选中的应用

3.3.2　在细胞DNA及蛋白质表征中的应用

3.3.3　在细胞代谢产物表征中的应用

参考文献

4.1　基因组测序技术的发展历程

4.2　基因组测序技术原理

4.2.1　第一代DNA测序技术原理

4.2.2　第二代测序技术原理

4.2.3　第三代测序技术原理

4.3　测序技术操作流程

4.3.1　第一代DNA测序技术操作流程

4.3.2　第二代测序技术操作流程和注意事项

4.3.3　第三代测序技术操作流程和注意事项

4.4　测序技术在细胞性能表征上的应用

4.4.1　测序技术在全基因组测序中的应用

4.4.2　测序技术在功能基因/元件挖掘中的应用

4.4.3　测序技术在微生物群落解析中的应用

4.4.4　测序技术在DNA甲基化检测中的应用

4.4.5　测序技术在疾病细胞检测中的应用

参考文献

5.1　质谱发展史及原理概述

5.2　质谱仪的离子源

5.2.1　电子轰击离子源

5.2.2　化学电离源

5.2.3　大气压化学电离源

5.2.4　电喷雾电离源

5.2.5　基质辅助激光解吸电离源

5.2.6　其他离子源

5.3　质量分析器

5.3.1　磁质谱

5.3.2　四极杆质谱

5.3.3　离子阱质谱

5.3.4　飞行时间质谱

5.3.5　傅里叶变换离子回旋共振质谱

5.3.6　离子淌度质谱

5.4　质谱技术在细胞性能表征中的应用

5.4.1　气相色谱-质谱联用技术在细胞分析中的应用

5.4.2　液相色谱-质谱联用技术在细胞分析中的应用

5.4.3　毛细管电泳-质谱联用技术在细胞分析中的应用

5.4.4　微流控芯片-质谱联用技术在细胞分析中的应用

参考文献

6.1　单细胞高通量筛选技术基本原理

6.1.1　高通量荧光流式单细胞表型筛选技术基本原理

6.1.2　高通量荧光液滴单细胞表型筛选技术基本原理

6.1.3　高通量拉曼流式单细胞表型筛选技术基本原理

6.1.4　高通量质谱流式单细胞表型筛选技术基本原理

6.2　单细胞高通量筛选技术体系构建及数据分析

6.2.1　荧光流式单细胞表型体系构建及数据分析

6.2.2　荧光液滴体系构建及数据分析

6.2.3　拉曼单细胞表型识别及数据分析

6.2.4　质谱单细胞表型识别及数据分析

6.3　单细胞高通量筛选技术在细胞性能表征上的应用

6.3.1　荧光流式单细胞表型筛选实例

6.3.2　荧光液滴单细胞表型筛选实例

6.3.3　拉曼流式单细胞表型筛选实例

6.3.4　质谱流式单细胞表型筛选实例

参考文献

7.1　微孔板培养高通量筛选技术背景

7.1.1　微孔板的发展历史

7.1.2　微孔板培养高通量筛选技术简介和发展趋势

7.2　微孔板培养高通量筛选技术原理

7.2.1　微孔板的类型和适用范围

7.2.2　微孔板培养技术原理

7.2.3　微孔板高通量筛选技术原理

7.2.4　微孔板培养高通量筛选的统计学分析

7.2.5　微孔板培养和高通量筛选的设备

7.3　微孔板培养高通量筛选技术方案设计

7.3.1　微孔板培养操作流程

7.3.2　微孔板筛选操作流程

7.4　微孔板培养高通量筛选常见问题和解决方案

7.4.1　微孔板培养常见问题和解决方案

7.4.2　微孔板筛选常见问题和解决方案

7.5　微孔板培养高通量筛选技术的应用

7.5.1　基于pH变化的微孔板高通量筛选

7.5.2　基于辅酶NAD（P）H的微孔板高通量筛选

7.5.3　基于化合物荧光的微孔板高通量筛选

7.5.4　基于生物传感器的微孔板高通量筛选

参考文献

8.1　微流控培养高通量筛选技术概述

8.1.1　微流控培养高通量筛选技术的需求

8.1.2　微流控培养高通量筛选技术的基本概念

8.1.3　微流控培养高通量筛选技术的发展历史和发展方向

8.2　微流控培养高通量筛选技术原理

8.2.1　微流控技术体系分类

8.2.2　微流控芯片内的流体控制原理

8.3　微流控培养高通量筛选技术方案设计

8.3.1　基于DREM cell的细胞培养和高通量筛选技术

8.3.2　基于MISS cell的细胞培养和高通量筛选技术

8.3.3　常见问题及解决方案

8.4　微流控培养高通量筛选技术应用

8.4.1　加速生物过程开发

8.4.2　高通量细胞筛选

8.4.3　药物评价与筛选

参考文献

9.1　实验室适应性进化原理

9.1.1　实验室适应性进化（ALE）概述

9.1.2　ALE的开展基础——突变

9.1.3　ALE的表征标准——适应度

9.1.4　ALE过程中的遗传动态

9.2　实验室适应性进化的基本策略

9.2.1　经典ALE策略

9.2.2　基于代谢网络重编程的ALE策略

9.2.3　基于遗传编码生物传感器的ALE策略

9.3　高效适应性进化新工具

9.3.1　基因型多样性：体内诱变工具

9.3.2　表型选择：多重自动化培养平台

9.3.3　基因型-表型关联：多组学分析和多重基因工程

9.4　实验室适应性进化技术在菌种选育中的应用

9.4.1　经典ALE策略

9.4.2　基于代谢网络重编程的ALE策略

9.4.3　基于遗传编码生物传感器的ALE策略

参考文献

10.1　平行发酵（细胞培养）技术的工作原理与设计思想

10.1.1　平行发酵（细胞培养）技术出现的背景

10.1.2　平行发酵（细胞培养）的设计思想

10.1.3　微型生物反应器高通量菌种筛选培养的“工业相似性”

10.1.4　商业化的平行发酵装置

10.2　平行发酵的实验设计（DoE）与数据处理软件

10.2.1　DoE的方法学

10.2.2　DoE在平行发酵实验中的应用

10.2.3　DoE软件与应用

10.2.4　DoE的实验数据分析

10.3　菌种保存、基础培养工艺和高通量分析检测技术

10.3.1　平行发酵实验中的海量菌种保存与设备

10.3.2　平行发酵基础培养工艺库的建立

10.3.3　高通量蛋白质和合成代谢产品的离线、在线检测

10.4　平行培养的通量、培养体积与过程数据采集的平衡

10.4.1　平行培养筛选的目标与培养通量/体积的平衡

10.4.2　培养通量/体积与过程控制和过程数据获取矛盾的解决方法

10.4.3　平行发酵（细胞培养）过程多变元批次模型的建立

10.5　平行发酵技术在菌种“工业相似”筛选中的应用

10.5.1　候选菌种根据目标产物产量的排序筛选

10.5.2　候选菌种以“过程驱动”为目的的高通量筛选

10.5.3　候选菌种以建立过程缩小模型为目的的筛选

参考文献