1.本书是一本较为理想的学习分子动力学模拟的门与提高读物。主要介绍经典分子动力学，以及路径积分分子动力学中所涉及的物理学原理、数值算法、编程实现和实际应用案例。2.本书采用更现代、实用的知识体系，由简繁，由简化的微正则系综手，一步步推广至正则系综和等温等压系综等更趋现实意义的模拟。3.本书编程实现主要基于python和C ，以及作者主导发的GPUMD。有助于读者对MD形成更深刻的理解与自研能力。4.加作者的GPUMD学习群，还可一同探讨交流MD模拟技术。相关代码托管于github。
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内容提要
作者简介
前言
第1章 分子动力学模拟的物理基础
1.1 牛顿力学
1.2 分析力学
1.3 热力学
1.4 经典统计力学
第2章 简单的分子动力学模拟程序
2.1 简单分子动力学模拟的基本要素
2.2 C++编程范例：一个简单的分子动力学模拟程序
2.3 程序的测试
第3章 模拟盒子与近邻列表
3.1 三斜盒子
3.2 近邻列表
3.3 C++编程范例：使用近邻列表的分子动力学模拟程序
3.4 GPUMD程序简介
第4章 经验势函数
4.1 经典势函数的一般性质
4.2 两个典型的经验多体势
4.3 C++编程范例：Tersoff势的编程实现
4.4 GPUMD使用范例：Tersoff势的使用
第5章 机器学习势
5.1 NEP机器学习势
5.2 NEP与经验势的结合
5.3 GPUMD中NEP机器学习势的使用
第6章 控温算法
6.1 Berendsen控温算法
6.2 BDP控温算法
6.3 Nose-Hoover控温算法
6.4 NHC控温算法
6.5 朗之万控温算法
6.6 GPUMD使用范例：几个控温算法的对比
第7章 控压算法
7.1 压强的微观计算与直观理解
7.2 Berendsen控压算法
7.3 SCR控压算法
7.4 Martyna-Tuckerman-Tobias-Klein控压算法
7.5 GPUMD中控压算法的使用范例
第8章 静态性质
8.1 统计误差
8.2 GPUMD使用范例：热膨胀模拟
8.3 径向分布函数
8.4 自由能计算
第9章 输运性质
9.1 线性响应理论与时间关联函数
9.2 自扩散系数
9.3 黏滞系数
9.4 热导率
9.5 GPUMD使用范例：晶体硅热导率计算
第10章 路径积分分子动力学
10.1 量子力学
10.2 量子统计系综
10.3 路径积分量子统计力学
10.4 路径积分分子动力学的算法
10.5 Python编程范例：路径积分分子动力学的积分算法
10.6 GPUMD使用范例：用PIMD计算水的径向分布函数
第11章 总结与展望
11.1 势函数
11.2 积分算法
11.3 物理量的测量
参考文献
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